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北京大學—遺傳流行病與統(tǒng)計基因組學/ai方向誠聘博士后、科研助理

簡介

課題組致力于解析人類疾病的遺傳學基礎。

課題組運用大型隊列、遺傳流行病學、統(tǒng)計基因組學、實驗生物學和深度學習等多學科方法，整合單細胞多組學及功能基因組學，解析人類疾?。òㄑ劭萍膊?、神經精神類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病等）的遺傳基礎和分子機制，揭示疾病發(fā)生、發(fā)展、轉化的復雜過程，識別關鍵生物標志物，發(fā)掘潛在藥物干預靶點，為疾病的早期篩查、風險預測、治療及預后評估等多方面提供精準化方案。

主要相關研究領域：

1）結合遺傳流行病學、統(tǒng)計基因組學與進化基因組學等方法，解析疾病的遺傳學基礎。

2）采用單細胞多組學、功能基因組學等方法與前沿技術，探究疾病從遺傳到表觀遺傳、從基因到蛋白表達、從細胞到組織器官的多層次信息調控機制。

3）深度學習在基因組學與健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)中的方法及應用。

4）主要研究疾病領域：眼科疾?。ㄇ喙庋?，視黃斑變性等）、神經精神類疾病、呼吸系統(tǒng)疾病等。

合作導師介紹

韓西坤，先后于中山大學、北京協(xié)和醫(yī)學院、澳大利亞昆士蘭大學/昆士蘭醫(yī)學研究所完成本科到博士階段的學習。2021年獲博士學位，博士研究方向為統(tǒng)計遺傳學，師從stuart macgregor教授。博士畢業(yè)后，赴哈佛大學公共衛(wèi)生學院流行病系，遺傳流行病與統(tǒng)計遺傳學項目（導師：liming liang教授）；麻省理工學院計算機與人工智能實驗室，broad institute of mit and harvard，計算生物學組（導師：manolis kellis教授）從事博士后研究。將于2024年加入北京大學，任研究員、博士生導師、新體制ttap。

獲國家青年人才項目（海外）、美國人類遺傳學會研究獎（charles j. epstein trainee research award）、澳大利亞csl florey next generation award、國家優(yōu)秀自費留學生獎學金等。

研究成果以第一/通訊作者發(fā)表于nature genetics（2篇）,american journal of human genetics,jama ophthalmology（3篇）, cell reports medicine, bmc medicine, european journal of epidemiology, international journal of epidemiology, human molecular genetics等期刊。

先后受邀為幾十個國際期刊審稿，包括nature genetics, cell genomics, american journal of human genetics, cell reports, nature communications, ophthalmology, jama ophthalmology, bmc medicine, european journal of epidemiology等。

代表性研究包括：1）基于大腦組織單細胞多組學，探究神經精神類疾病的功能基因組學基礎（nature，under review, first author）；2）基于多組學、功能基因組學，鑒定潛在的青光眼基因藥物靶點(nature genetics 2023)；3）整合大型隊列遺傳學，鑒定青光眼易感位點，系統(tǒng)評價遺傳風險預測模型及臨床應用價值(nature genetics 2020)；4）采用深度學習、大規(guī)模影像學、基因組學，進行跨種族遺傳學研究(american journal of human genetics 2021)。

崗位1：博士后（計算方向/實驗方向）

招聘人數(shù)：2-3名

崗位職責：

1）與導師合作，提出科學問題、開展課題研究；

2）計算方向主要課題：a) genetics and single cell genomics; b) ai in genomics and healthcare；

3）實驗方向：開展分子遺傳學、功能基因組學等相關研究，采用細胞/動物模型、單細胞多組學、空間組學、organoid、ipsc、mpra、crispr等技術，探究疾病遺傳調控機制。

應聘條件（滿足以下之一）：

1）已取得或即將取得博士學位，有志于從事科學研究，學習能力較強，良好的溝通能力和合作精神；

2）對統(tǒng)計基因組學、深度學習、計算生物學、功能基因組學，或腦科學、神經精神類疾病、眼科學等方向的科研工作有興趣。

3）計算方向：具有計算機、統(tǒng)計學、生物信息學、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學、遺傳學等計算背景。熟悉常用統(tǒng)計或深度學習方法（vae/cnn/transformer/diffusion model等），熟悉至少一門編程語言（python/r等)及linux系統(tǒng)操作等。

4）實驗方向：具有分子生物學、生物化學和生物醫(yī)學相關實驗學科背景（眼科學、神經生物學優(yōu)先）；熟悉以下之一：細胞/動物模型、單細胞多組學、空間組學、organoid、ipsc、mpra、crispr等。課題組將為實驗背景的同學提供計算方向的科研培訓。

崗位待遇：

博士后申請者薪酬福利請參考：https://postdocs.bjmu.edu.cn/index.htm

全力協(xié)助申報博士后相關項目;根據(jù)研究興趣，全力協(xié)助實現(xiàn)職業(yè)發(fā)展規(guī)劃。

崗位2：科研助理

招聘人數(shù)：1人

崗位職責：

1）參與或獨立開展課題研究。

2）實驗方向能開展分子遺傳學、功能基因組學、單細胞/空間轉錄組等相關研究。

應聘條件（滿足以下之一）：

1）已取得或即將取得本科或碩士學位，有志于從事科學研究，學習能力較強，良好的溝通能力和合作精神；

2）計算方向：具有計算機、統(tǒng)計學、生物信息學、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學、遺傳學等相關計算背景。熟悉常用的統(tǒng)計/深度學習方法，熟悉一門編程語言（python/r等)及linux系統(tǒng)操作等。

3）實驗方向：具有分子生物學相關實驗學科背景（眼科學、神經生物學優(yōu)先）。

崗位待遇：

根據(jù)北京大學醫(yī)學部相關規(guī)定執(zhí)行，簽定勞務派遣合同，薪資面議，交五險一金。

應聘程序

請將應聘材料發(fā)送至相關郵箱，請【點擊下方“立即投遞/投遞簡歷”，即刻進行職位報名】，郵件標題請注明"應聘-崗位(博士后)-姓名"或"應聘-崗位(科研助理)-姓名"。

應聘材料

個人簡歷（包括學習工作經歷、主要研究工作內容、論文論著清單、成績單、獲獎情況、科研興趣及未來研究計劃）及其他有借鑒意義的材料。請將材料合并為一個pdf。

其他說明

1）本招聘長期有效。

2）郵件若一周內未回復，請再次提醒。符合要求申請者將會盡快安排面試。

3）歡迎對課題組研究方向感興趣的本科生、碩士生、博士生、訪問學者合作交流。

部分發(fā)表論文列表

? ?joint first author, *corresponding author ?

●han x?*, gharahkhani p?, hamel ar, ong js, …, hewitt aw, craig je, pasquale lr, mackey da, wiggs jl, khawaja ap, segrè av, macgregor s. large scale multi-trait genome-wide association analysis identifies hundreds of glaucoma risk loci.nature genetics. 2023; 55(7):1116-1125

●craig je?,han x?*, qassim a?, hassall m, …, wiggs jl, hewitt aw, macgregor s. multitrait analysis of glaucoma identifies new loci and enables effective polygenic risk score prediction of disease susceptibility, progression.nature genetics. 2020; 52(2):160-166.

●han x*, steven k, qassim a, marshall hn, bean c, tremeer m, an j, siggs om, gharahkhani p, craig je, hewitt aw, trzaskowski m, macgregor s. automated ai labelling of optic nerve head enables new insights into cross-ancestry glaucoma risk and genetic discovery in >;280,000 images from ukb and clsa.american journal of human genetics. 2021; 108(7):1204-1216.

●han x*, lains i, li j, li j, chen y, yu b, qi q, boerwinkle e, kaplan r, thyagarajan b, daviglus m, joslin ce, …, miller j, hu f, willett w, lasky-su j, kraft p, richards jb, macgregor s, husain d, liang l. integrating genetics and metabolomics from multi-ethnic and multi-fluid data reveals putative mechanisms for age-related macular degeneration.cell reports medicine. 2023;4(7):101085.

●han x*, hewitt aw, macgregor s. predicting the future of genetic risk profiling of glaucoma: a narrative review.jama ophthalmology. 2021;139(2):224-231.

●han x?, souzeau e?, ong js, an j, siggs om, burdon kp, …, hewitt aw, gharahkhani p, craig je, macgregor s. myocilin gene gln368ter variant penetrance and association with glaucoma in population-based and registry-based studies.jama ophthalmology. 2019; 137(1):28-35.

●han x*, gharahkhani p, mitchell p, liew g, hewitt aw, macgregor s. meta-analysis of genome-wide association studies identify novel genes for age-related macular degeneration.journal of human genetics. 2020; 65(8):657-665.

●han x*, ong js, hewitt aw, gharahkhani p, macgregor s. the effects of eight serum lipid biomarkers on age-related macular degeneration risk: a mendelian randomization study.international journal of epidemiology. 2021; 50(1):325-336.

●han x*, liang l*. metabolomicsr: a streamlined workflow to analyze metabolomic data in r.bioinformatics advances. 2022; 2(1):vbac067.

? co-author ?

●daniszewski m, senabouth a, liang lh,han x, lidgerwood ge, hernández d, …, mackey da, craig je, macgregor s, powell je, pébay a, hewitt aw. retinal ganglion cell-specific genetic regulation in primary open angle glaucoma.cell genomics2022, 2, 100142.

●senabouth a, daniszewski m, lidgerwood ge, liang hh, hernández d, mirzaei m, keenan sn, zhang r,han x, neavin d, rooney l,… , mackey da, bylsma g, verma n, macgregor s, watt mj, guymer rh, powell je, hewitt aw, pébay a. transcriptomic and proteomic retinal pigment epithelium signatures of age-related macular degeneration.nature communications. 2022 26;13(1):4233.

●gharahkhani p., jorgenson e., hysi p., khawaja a.p., pendergrass s.,han x, ong j.s., hewitt a. w., …, mackey d.a., kubo m., aung t., craig j. e., macgregor s., wiggs j. l.. genome-wide meta-analysis identifies 127 open-angle glaucoma loci with consistent effect across ancestries.nature communications. 2021;12(1):1258.

●ong js, an j,han x, law mh, nandakumar p, …, gharahkhani p, kendall bj, macgregor s. multitrait genetic association analysis identifies 50 new risk loci for gastro-oesophageal reflux, seven new loci for barrett’s oesophagus and provides insights into clinical heterogeneity in reflux diagnosis.gut. 2021; gutjnl-2020-323906.

●macgregor s, ong js, an j,han x, zhou t, siggs om, …, mackey da, gharahkhani p, craig je, hewitt aw. genome-wide association study of intraocular pressure uncovers new pathways to glaucoma.nature genetics. 2018; 50(8):1067-1071.

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